单细胞研究未来的热点趋势-单细胞多组学ATAC+转录组

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单细胞多组学 ATAC + 转录组是一种以数千个细胞为研究对象，同时分析同一细胞中的基因表达和开放染色质的技术，它可以带来细胞的基因表达谱及其表观基因组景观的一体化视图。随着单细胞测序技术的飞速发展，单细胞多组学已经成为单细胞技术发展的重要方向，很多研究者不再满足于只研究基因表达，其更注重探索基因表达背后的转录调控机制，于是染色质可及性研究成为众多研究者的选择。据统计，近 5 年来研究染色质可及性文章以平均每年 20.1% 的比例迅速增长，在 2021 年更是达到最高增长比例 31.1%。

图1 同一细胞中基因表达和染色质状态的同时检测

随着研究需求不断增多，单细胞测序技术也随之飞速革新，2022 年樊荣团队在 Nature 上发表了 Spatial-ATAC-seq，开启空间表观组学新篇章；南京科技大学在 Nature Method 上发布了单细胞多组学技术 ISSAAC-seq，实现在同一细胞内兼顾高低通量且同时进行 ATAC+ 转录组的测序技术，扩大单细胞多组学研究途径。这两项染色质可及性研究技术被评为单细胞测序技术的十大里程碑事件，推动了单细胞多组学技术的进一步发展。

图2 与目标基因直接关联的推定调控元件的鉴定

目前单细胞多组学 ATAC+ 转录组解决方案广泛应用于各类研究成果中，已在 2021-2022 两年间支持 53 篇文章发表，其中包含 Nature 4 篇、Cell 3 篇、Science 2 篇^[1]。这些文章从更深入地鉴定细胞类型和状态，通过表观基因组和基因表达谱的综合分析来鉴定复杂的细胞群体，并捕获细胞异质性，从而发现隐藏的信息，利用基因表达标志物解释表观遗传图谱；到发现新的基因调控相互作用，将调控元件的发现与基因表达相结合，探索驱动细胞分化、发育和疾病的基因调控相互作用，探索疾病的复杂性，了解疾病中的基因调控网络如何被破坏，研究表观遗传重塑和治疗耐药的机制。单细胞多组学充分利用您的宝贵样本，从同一细胞中获得转录组和开放染色质信息，让您从有限样本中得到尽可能多的发现。

注：[1] 数据来源2023年2月16日10x Genomics 官网

图3 高效而强大的单细胞多组学 ATAC+ 转录组工作流程

图4 生成高质量的单细胞转录组和 ATAC 文库

博奥晶典单细胞空间测序平台

博奥晶典作为国内第一家引进10x Genomics平台的公司，率先在国内开展上万级通量的单细胞转录组测序服务。目前已经完成了10000多例样品、几百种不同样品类型的服务，覆盖的物种和样品类型包括人和小鼠的肝脏、肺脏、皮肤、心脏、脑、肾脏、血液、卵巢、神经，以及鸡、斑马鱼、猪、水稻、拟南芥、油菜、白菜、橄榄等，是目前国内大规模单细胞测序经验极丰富的公司。

博奥晶典于2019年12月同时获得了单细胞转录组，单细胞ATAC，单细胞免疫组库3个服务产品的官方CSP认证，并于2020年9月获得了空间转录组产品的官方CSP认证，成为目前国内唯一一家同时获得4项10x Genomics平台服务官方认证的公司。

博奥晶典支持单细胞测序文章分别发表在 Nature、Cell、Cancer Discovery、Circulation、Cell Stem Cell、Journal of Hepatology、Cell Research、Nature Immunology、Nature Cell Biology、GUT、Advanced Science 等期刊，应用领域涉及细胞图谱绘制、类器官、生殖发育、干细胞、血管老化、血管异质性、肿瘤异质性、肿瘤免疫治疗、疾病机制研究等。

博奥晶典累计支持客户发表单细胞时空组学文章 132篇，总影响因子超 2524 分，其中单细胞组学文章 124 篇，影响因子 2365 分，空间组学文章 8 篇，影响因子 159 分。是目前国内支持发文最多、累计影响因子最高的公司。

■ 博奥晶典目前可开展以下单细胞空间测序产品和服务：

客服热线：400-9968-999

（工作日 08:00-18:00）

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